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　　嬰兒一出生，首次暴露在微生物中之后，生命就開(kāi)始受到無(wú)休止的圍攻。各種細菌、病毒和真菌將它們的**開(kāi)拓進(jìn)入類(lèi)的皮膚、眼睛、肺、胃腸道等每一處暴露的器官。瑞爾曼說(shuō)：“在面對病原體時(shí)，我們必須克服‘一種細菌一種病’的整體一維視角，菌群才是研究單位。”
　　人類(lèi)細胞和他們的微生物搭檔作為一種互相促進(jìn)的“超級有機體”，各自都為對方提供了服務(wù)。美國國家衛生研究院2007年末開(kāi)始了一項為期5年的人類(lèi)微生物組計劃(HMP)，致力于給人類(lèi)龐大的微生物組測序。項目主管麗塔?普羅科特說(shuō)：“要真正理解我們作為一個(gè)有機體的功能，需要包括人體的整個(gè)微生物群落，它們與我們的健康和生命息息相關(guān)，工作量比人類(lèi)基因組還要大100倍。”今年研究人員完成了取自人體不同部位的178種微生物基因組的測序和分析，發(fā)現其基因編碼含有超過(guò)3萬(wàn)種蛋白質(zhì)。
　　盡管生態(tài)微生物學(xué)提供了一個(gè)框架來(lái)理解人類(lèi)微生物群落，但它的所有方法和原則，離臨床應用都還有一定距離。即使研究人員找到了某種細菌和某種疾病之間的確切聯(lián)系，也沒(méi)辦法通過(guò)清除一種細菌或引入另一種細菌的方法來(lái)控制細菌群落。抗生素傾向于殺死相關(guān)的細菌，而不能殺死一個(gè)菌群，更無(wú)法產(chǎn)生菌群或移植它們。