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    用更廣闊的全腫瘤（cross-tumour）理念對各種腫瘤進(jìn)行分類(lèi)不僅能夠為我們 提供一個(gè)嶄新的生物學(xué)研究視野，同時(shí)也能夠給臨床工作提供更多更有價(jià)值的相關(guān)信息。Kandoth課題組就用實(shí)際的工作向我們證實(shí)了這種泛腫瘤（pan- cancer）研究方法的威力和價(jià)值，其實(shí)他們關(guān)注的重點(diǎn)非常簡(jiǎn)單，就是基因編碼區序列里的單堿基替換突變，以及短片段的缺失或插入突變這些已經(jīng)被眾多的 科研人員研究過(guò)千萬(wàn)遍的常見(jiàn)突變。他們選擇了12種不同類(lèi)型的腫瘤作為研究對象，一共采集了3281個(gè)腫瘤樣本并進(jìn)行了聯(lián)合分析，通過(guò)對這些腫瘤標本中他 們所關(guān)注的突變的出現幾率（recurrence rates）進(jìn)行非常“苛刻的”統計學(xué)分析之后發(fā)現了127個(gè)突變基因在腫瘤的發(fā)病過(guò)程中起到了非常重要的作用。雖然在他們得出的這份腫瘤突變名單中有很 多突變基因之前就已經(jīng)被人報道過(guò)，但是Kandoth等人卻是用腫瘤全視野的角度發(fā)現這些突變基因的第一人。

    Kandoth等人隨后也利用腫瘤基因組計劃（Cancer Genome Atlas, TCGA）收集的臨床數據（比如患者腫瘤復發(fā)的時(shí)間或死亡的時(shí)間）對這127個(gè)突變基因在疾病預后預測方面的價(jià)值進(jìn)行了評估。雖然進(jìn)行這種大視野研究存在 種種困難，比如各個(gè)標本的臨床特征就非常復雜，在患病年齡、治療情況、腫瘤的轉移能力等方面都有很大的差異，但是由于采集的標本量足夠大，所以也足以發(fā)現 有價(jià)值的信息。比如BAP1、DNMT3A、KDM5C、FBXW7以及TP53這幾個(gè)基因如果發(fā)生突變，患者的預后就會(huì )比較差。而B(niǎo)RCA2和IDH1 這兩個(gè)基因如果發(fā)生突變則往往預示著(zhù)預后會(huì )比較好。

    不過(guò)在此也有必要提醒一下，這種多腫瘤分析的方式也有其弊端，比如就會(huì )漏掉與某種特定腫瘤高度相關(guān)的突變，例如與膀胱癌高度相關(guān)的KDM6A和 ARID1A基因，所以我們應該兩手都要硬，將單一腫瘤分析與多種腫瘤分析的方式緊密地結合起來(lái)。可是如果我們用大樣本人群對上述多腫瘤研究工作所發(fā)現的 相關(guān)突變基因的預后判斷價(jià)值進(jìn)行驗證之后，就能夠以這些突變基因為分子標志物，提早發(fā)現腫瘤可能轉移、復發(fā)的高危人群，對他們給予相應的治療和關(guān)注，改善 他們的預后。在通過(guò)多基因表達譜分析所發(fā)現的早期乳腺癌患者人群中已經(jīng)開(kāi)始使用這種預后干預策略了。將來(lái)我們還可以對這些標志物與抗癌藥物治療反應性等指 標的關(guān)系進(jìn)行研究，不過(guò)這也需要更進(jìn)一步的整合臨床試驗和各個(gè)腫瘤中心的基因組數據資源，因而也需要建立一套更利于各個(gè)不同研究機構之間進(jìn)行數據共享的機 制。

    泛腫瘤分析方法簡(jiǎn)介。腫瘤基因組研究項目組收集了患有12種主要腫瘤的上萬(wàn)名患者的資料，通過(guò)對腫瘤變異情況和臨床數據的比較和分析，獲得了一系列非常有價(jià)值的發(fā)現。

    另外這種全腫瘤研究工作對藥物開(kāi)發(fā)工作的幫助有多大呢？有一種策略就是對其中所有的藥物作用靶標進(jìn)行一次篩選，縮小范圍以便提高藥物開(kāi)發(fā)工作的針對性。不 過(guò)這并不是全腫瘤研究工作的最大價(jià)值，通過(guò)全腫瘤研究工作可以更進(jìn)一步明確各基因或信號通路之間的功能聯(lián)系，這才是最重要的意義。因為掌握了這些信息，如 果再碰到某個(gè)基因編碼的蛋白質(zhì)不太適合當做藥物作用靶點(diǎn)的時(shí)候，我們就可以繞過(guò)它，只需要選擇該蛋白所在信號通路上的其它分子作為靶點(diǎn)，也能夠起到同樣的 治療效果。最近有好幾個(gè)腫瘤基因組研究項目所發(fā)現的腫瘤相關(guān)信號通路（比如RNA剪接通路、轉錄調控通路以及代謝作用通路等等）全都在這個(gè)泛腫瘤研究工作 中得到了驗證，所以這些通路全都可以當做抗癌藥物開(kāi)發(fā)工作人員們的重點(diǎn)關(guān)注對象。

    如果被我們納入到泛腫瘤研究項目當中的腫瘤種類(lèi)進(jìn)一步增加，所關(guān)注的突變類(lèi)型更進(jìn)一步豐富（比如也關(guān)注非編碼區里的突變），對基因組的注釋也更加完全，那 么在今后開(kāi)展的泛腫瘤研究工作當中一定會(huì )有更加重要的發(fā)現。所有這些腫瘤的共同之處（所發(fā)現的突變）能夠幫助科研人員開(kāi)展更好的實(shí)驗室研究，為藥物開(kāi)發(fā)人 員提供更多更有價(jià)值的作用靶點(diǎn)，也有助于臨床醫生們選擇更好的治療方案，所以它們一定會(huì )造福全世界的癌癥患者。