HIV 病毒主要通過(guò)兩種表面蛋白感染人體T淋巴細胞,這兩種表面蛋白聚集成蘑菇狀的三聚體(trimers)結構。由于技術(shù)的限制,我們很難大量獲得這種三聚體 蛋白,所以一直都沒(méi)有得到一幅清晰的三聚體晶體結構圖。這種三聚體蛋白在天然 HIV 病毒上是破病毒胞膜而出的一種表面蛋白,如果科研人員們只表達出三聚體蛋白,但是沒(méi)有相應的搭配胞膜分子,那么三聚體極易解離,根本無(wú)法對其進(jìn)行研究。所 以很多科研機構都會(huì )對三聚體蛋白進(jìn)行一些人工突變革造,使其更加穩定,但是這樣一來(lái)我們得到的又不是天然蛋白的信息了。
經(jīng)過(guò)近 20 年的努力,科研人員終于人工制造出了一個(gè)據他們稱(chēng)在結構上能夠模擬 HIV 表面蛋白天然結構的人工蛋白。眾多科研人員對此都給予了很高的期望,大家相信這些“近乎天然的”人工蛋白質(zhì)能夠像幫助 RSV 疫苗開(kāi)發(fā)工作那樣,將艾滋病疫苗開(kāi)發(fā)工作引入一個(gè)全新的時(shí)代。最近新報道的三項科研進(jìn)展(其中有兩項已經(jīng)在最新出版的《科學(xué)》雜志上進(jìn)行了報道)必將就蛋白質(zhì)的精細結構,以及這些位于 HIV 病毒表面,聚集在一起像蘑菇一樣的蛋白質(zhì)如何引發(fā)機體產(chǎn)生抗 HIV 免疫反應等問(wèn)題引發(fā)長(cháng)久的討論。
本期《科學(xué)》雜志刊登的這兩篇文章向我們介紹了美國加利福尼亞洲圣地亞哥 Sc**ps 研究所的Ian Wilson 所帶領(lǐng)的一群結構生物學(xué)家是如何最終獲得了高分辨率的、近天然三聚體蛋白的晶體結構。他們成功的關(guān)鍵是一種在實(shí)驗室里制備的、穩定的三聚體蛋白,這些蛋白是由美國紐約康奈爾大學(xué)Weill醫學(xué)院的免疫學(xué)家John Moore 提供的。美國馬里蘭州貝塞斯達美國變態(tài)反應和感染性疾病研究院疫苗研究中心專(zhuān)門(mén)從事 HIV 和 RSV 病毒研究的結構生物學(xué)家 Peter Kwong 評價(jià)道:“如果讓我們這幫從事結構生物學(xué)研究的人列出一個(gè)十大夢(mèng)想榜單,那這種蛋白絕對是上榜明星之一。”
這一成果有望幫助科研人員設計出疫苗最重要的組成部分——免疫原,有效的免疫原就能夠**機體產(chǎn)生出被廣大免疫學(xué)家認為能夠清除 HIV 病毒的廣譜中和抗體。科學(xué)家們很難從 HIV 病毒感染者體內分離得到 bNAb 抗體,一方面是因為這種抗體只有在感染發(fā)生數年之后才會(huì )出現,另外一方面是因為即便產(chǎn)生了抗體,其滴度也是非常低的。機體產(chǎn)生的抗體可能根本就不能中和 HIV 病毒,病毒也可以通過(guò)突變的方式逃過(guò)普通抗體的“抓捕”,不過(guò)這一套對 bNAb 抗體都不管用,這種抗體能夠與多種不同的病毒毒株結合,詳見(jiàn) Science, 13 September, p. 1168.VRC 的主任 John Mascola 認為,這真是一項非常漂亮、精彩的工作。他相信之后肯定會(huì )掀起一股免疫原設計風(fēng)潮。
Moore 等人花了15年時(shí)間來(lái)嘗試制造出一個(gè)穩定的、天然的三聚體蛋白,他們的方法是在天然蛋白中添加幾個(gè)新的化學(xué)鍵,同時(shí)去除掉一些使蛋白能維持天然構象的序列。這一成果終于使爭論了多年的三聚體結構問(wèn)題得以平息,詳見(jiàn) Science, 2 August, p. 443. Kwong 等人認為,這個(gè)新結構非常可信,因為用X線(xiàn)晶體學(xué)(x-ray crystallography)和結晶電鏡(cryo-electron microscopy)這兩項技術(shù)對其進(jìn)行檢測,得到的結果是完全一樣的。美國**癌癥研究院的一個(gè)課題組在對《科學(xué)》雜志之前報道過(guò)的一些三聚體蛋白進(jìn)行了結構分析之后也認為這個(gè)新結構是可信的,他們的文章已經(jīng)在今年 10 月 23 日發(fā)表在《自然 結構與分子生物學(xué)》雜志的網(wǎng)絡(luò )版上。
Wilson 認為,這種精細的近天然三聚體結構圖可能會(huì )給疫苗開(kāi)發(fā)人員很多靈感,讓他們更了解病毒的感染機制,進(jìn)而更好地清除這些病毒。 Moore 相信,既然天然的三聚體蛋白就能夠**人體產(chǎn)生 bNAb 抗體,那么這種近天然的人工蛋白疫苗的免疫保護效果肯定要比之前使用過(guò)的各種非天然蛋白疫苗好得多。試管試驗也發(fā)現, bNAb 抗體對天然三聚體蛋白的親和力更高。“我并不是說(shuō)所有的 bNAb 抗體都是因為天然的三聚體蛋白**產(chǎn)生的,但是我認為其中有很多 bNAb 抗體是這樣產(chǎn)生的。” Moore 這樣說(shuō)道。
Moore 實(shí)驗室制備的這些近天然三聚體蛋白還沒(méi)有被用于動(dòng)物實(shí)驗,不過(guò)這些工作已經(jīng)在逐步開(kāi)展之中了。好幾個(gè)制備非天然結構免疫原的實(shí)驗室也提醒說(shuō),不要因為 bNAb 抗體能夠與三聚體蛋白結合就認為三聚體蛋白一定能夠**機體產(chǎn)生 bNAb 抗體。“這兩篇文章向我們展示了一個(gè)非常漂亮的結構生物學(xué)成果,但是不論這個(gè)結果在我們這些‘旁觀(guān)者’眼里看起來(lái)有多么漂亮,人體免疫系統才是最終的裁判。所以只有時(shí)間才能告訴我們,這些人工三聚體蛋白究竟是改變游戲局面的局勢扭轉者,還是只能起到一定的促進(jìn)作用而已。”英國倫敦帝國理工學(xué)院的免疫學(xué)家 Robin Shattock 這樣評價(jià)道。
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