青霉素和其他抗生素的出現使醫藥發(fā)生了革命性的改變,將曾經(jīng)是致死性的疾病轉變?yōu)榱巳菀字斡募膊 H欢M管抗生素在臨床上應用已有70多年,其殺死細菌的確切機制卻仍是一個(gè)待解之謎。
近日來(lái)自麻省理工學(xué)院和波士頓大學(xué)的研究人員揭開(kāi)了三類(lèi)主要的抗生素潛在的殺傷機制:藥物生成了一些破壞性分子,通過(guò)一連串細胞事件對細胞DNA造成了致命性的損傷。相關(guān)論文發(fā)表在4月20日的《科學(xué)》(Science)雜志上。
研究人員表示詳細了解這一機制可以幫助科學(xué)家們改進(jìn)現有的藥物。在過(guò)去40年只有少數的新抗生素被開(kāi)發(fā)出來(lái),而大量的細菌株卻對當前可用的藥物產(chǎn)生耐受。
波士頓大學(xué)生物醫藥工程學(xué)教授James Collins說(shuō):“這有可能提高我們當前‘武器庫’的殺傷效應,減少所需劑量,或使細菌株對現有的抗生素重新敏感。
破壞性的自由基
2007年,Collins證明三類(lèi)主要的抗生素——喹諾酮類(lèi)、β-內酰胺類(lèi)和氨基糖苷類(lèi)——可通過(guò)生成高度破壞性的分子羥基自由基(hydroxyl radicals)來(lái)殺傷細菌細胞。當時(shí),他和其他的研究人員就猜測自由基對它們遭遇的所有細胞成分發(fā)動(dòng)了全面的攻擊。
麻省理工學(xué)院生物學(xué)教授Graham Walker 說(shuō):“它們幾乎對一切都產(chǎn)生反應。它們會(huì )追擊脂質(zhì)、它們能氧化蛋白,它們能氧化DNA。”然而在新研究中,研究人員發(fā)現這種損傷大部分并非是致命性的,
研究人員證明能對細菌造成致死性損傷的是羥基誘導的鳥(niǎo)嘌呤損傷,鳥(niǎo)嘌呤(G)是組成DNA的四個(gè)基本核苷酸堿基之一。當這種損傷的鳥(niǎo)嘌呤插入到DNA中時(shí),細菌會(huì )致力修復這種損傷,但最終加速了自身的死亡。“這并非是導致所有殺傷效應的原因,但事實(shí)它卻占據了相當重要的比重,”Walker說(shuō)。
最初,Walker對于DNA修復酶的研究令到研究人員懷疑這種氧化鳥(niǎo)嘌呤有可能在抗生素介導的細胞死亡中發(fā)揮了作用。在第一個(gè)研究階段,他們發(fā)現了一種特異的DNA聚合酶DinB非常善于利用氧化鳥(niǎo)嘌呤元件來(lái)合成DNA。
然而,DinB不僅在DNA復制過(guò)程中將氧化鳥(niǎo)嘌呤插入到了其正確堿基對胞嘧啶(C)的對面,還將其插入到了腺嘌呤(A)的對面。研究人員發(fā)現當太多氧化鳥(niǎo)嘌呤被摻入到新的DNA鏈中時(shí),細胞將無(wú)法成功去除這些損害,因此導致了死亡。
基于這些基礎的DNA修復研究,Walker和他的同事們于是猜測抗生素生成的羥基自由基是否有可能引發(fā)了相同的一連串的DNA損傷。事實(shí)證明果然如此。
一旦抗生素處理導致的氧化鳥(niǎo)嘌呤插入到DNA中,一個(gè)旨在修復DNA的細胞系統就會(huì )采取行動(dòng)。一些稱(chēng)之為MutY 和 MutM的特異性酶通過(guò)剪斷DNA來(lái)啟動(dòng)胞修復過(guò)程,正常情況下這一修復機制可以幫助細胞應對DNA中存在的氧化鳥(niǎo)嘌呤。 然而這種修復也是具有高風(fēng)險的,因為它需要打開(kāi)DNA雙螺旋,在錯誤堿基被替換時(shí)切斷DNA鏈。如果兩種這樣的修復在DNA反向鏈附近的位置同時(shí)發(fā)生,那么DNA就會(huì )發(fā)生雙鏈斷裂,這通常對細胞具有致命效應。
“原本應該保護你,確保準確性的系統變成了劊子手。”Walker說(shuō)。
哈佛醫學(xué)院微生物和免疫生物學(xué)教授Deborah Hung說(shuō):“新研究代表隨著(zhù)我們重新了解抗生素的作用機制會(huì )開(kāi)啟下一個(gè)重要的篇章。我們過(guò)去思考我們所知的,現在我們意識到所有的簡(jiǎn)單假設都是錯誤的,它其實(shí)更為的復雜。”
新目標
研究人員表示在某些情況下抗生素誘導的DNA損傷,細菌細胞能夠通過(guò)利用一個(gè)稱(chēng)之為同源重組的過(guò)程修復雙鏈DNA斷裂從而挽救自身。使得同源重組所需的酶失活有可能提高細菌對抗生素的敏感性。
“我們的工作表明參與雙鏈DNA斷裂修復的蛋白有可能成為非常有意思值得探究的靶標,成為改變藥物殺傷效應的一條途徑。”Collins說(shuō)。
此外,研究人員還證實(shí)還有另外一條機制參與了氨基糖苷類(lèi)抗生素引起的細胞死亡。在這些抗生素處理的細胞中,氧化鳥(niǎo)嘌呤被摻入到了信使RNA中,導致了錯誤蛋白生成,轉而啟動(dòng)更多的羥基自由基生成,由此產(chǎn)生更多的氧化鳥(niǎo)嘌呤。研究人員目前正在致力進(jìn)一步地了解抗生素殺傷細菌的機制。
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