SCCS為膀胱癌診斷、治療提供了新思路
2013-10-20 22:16
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來(lái)源:生物通
作者:網(wǎng)*
責任編輯:網(wǎng)絡(luò )
[導讀] 由深圳華大基因研究院、深圳市第二人民醫院(簡(jiǎn)稱(chēng)市二院)等單位組成的科研團隊,通過(guò)對99個(gè)膀胱癌患者樣本進(jìn)行全基因組及全外顯子測序研究,發(fā)現了與姐妹染色單體結合及分離(sister chromatid cohesion and segregation, SCCS)相關(guān)的基因突變,為膀胱癌診斷、治
由深圳華大基因研究院、深圳市第二人民醫院(簡(jiǎn)稱(chēng)市二院)等單位組成的科研團隊,通過(guò)對99個(gè)膀胱癌患者樣本進(jìn)行全基因組及全外顯子測序研究,發(fā)現了與姐妹染色單體結合及分離(sister chromatid cohesion and segregation, SCCS)相關(guān)的基因突變,為膀胱癌診斷、治療提供了新思路.最新研究成果于2013年10月13日在《自然遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上發(fā)表.
膀胱癌發(fā)病率居泌尿系統惡性腫瘤的首位,而在西方國家其發(fā)病率僅次于前列腺癌,居第2位.膀胱移行細胞癌(TCC)是膀胱癌中最常見(jiàn)的組織學(xué)類(lèi)型,男性發(fā)病率約為女性的3~4倍,多發(fā)生于40-70歲之間.目前,中國男性膀胱癌的年發(fā)病率已達十萬(wàn)分之八,并呈逐年上升的趨勢.對于這一重要癌癥,目前卻沒(méi)有充足的基因組學(xué)數據供科研人員開(kāi)發(fā)新的治療方法以攻克膀胱癌.
來(lái)自華大基因和市二院的科研人員對99個(gè)膀胱癌患者的組織樣本進(jìn)行了全基因組測序和全外顯子測序,共發(fā)現13個(gè)重要的新突變基因和24個(gè)已知突變基因如TP53,HRAS, FGFR3,PIK3CA以及KRAS等.在所發(fā)現的新突變基因中,位于X染色體上的STAG2基因顯得尤為特別,該基因與SCCS過(guò)程息息相關(guān).科研人員發(fā)現STAG2基因發(fā)生了高頻非同義突變,并且11個(gè)發(fā)生該基因突變的樣品中有9個(gè)都是終止突變.此外,與SCCS相關(guān)的ESPL1基因也發(fā)生了高頻突變.
研究人員還通過(guò)轉錄組測序對42對組織樣品進(jìn)行了研究,結果發(fā)現有32個(gè)潛在的基因重排可能會(huì )導致基因融合,并證實(shí)FGFR3和TACC3基因發(fā)生了融合.研究還發(fā)現,TACC3的高表達不是TACC3基因自身的擴增導致的,而是通過(guò)FGFR3這個(gè)轉錄調控因子來(lái)調節的.
此外,研究結果顯示染色體的非整倍體性及不穩定性與膀胱癌發(fā)生有關(guān),并使膀胱癌成為首個(gè)擁有SCCS相關(guān)基因突變的癌癥.此外,本研究為膀胱移行細胞瘤提供了更全面綜合的基因組突變信息,并證明基因突變可影響SCCS過(guò)程,同時(shí)為膀胱癌的診斷治療提供了一種新的可能性.
華大基應該項目負責人陳超指出:"在這次研究中,我們發(fā)現了多個(gè)與SCCS相關(guān)的突變,包括STAG2、ESPL1基因的高頻突變以及FGFR3-TACC3基因融合.這一發(fā)現證實(shí)SCCS相關(guān)基因突變確實(shí)與膀胱癌的發(fā)生有關(guān),極大地推動(dòng)了膀胱癌遺傳學(xué)研究,同時(shí)也為膀胱癌的診斷治療提供了新思路.此外,研究中所獲得的數據資源也為以后膀胱癌的深入研究奠定了重要的科研基礎."