您所在的位置:首頁(yè) > 內分泌科醫學(xué)進(jìn)展 > Nature:127個(gè)突變基因致12種癌癥類(lèi)型
作為“癌癥基因組圖譜”之Pan-Cancer項目的一部分,本文作者發(fā)表了對來(lái)自超過(guò)3000個(gè)腫瘤、代表12個(gè)腫瘤類(lèi)型的點(diǎn)突變和小“得失位”所做的數據分析。他們的發(fā)現包括127個(gè)顯著(zhù)突變的基因,它們來(lái)自與癌癥有已經(jīng)確定的聯(lián)系和新發(fā)現聯(lián)系的細胞過(guò)程。他們還發(fā)現,腫瘤形成所需的驅動(dòng)突變的數量是相對較小的。進(jìn)一步的分析還識別出了對存活有顯著(zhù)影響的基因以及腫瘤發(fā)生過(guò)程中的突變事件的可能時(shí)間順序。
來(lái)自華盛頓大學(xué)醫學(xué)院的科學(xué)家們通過(guò)檢測12種主要的癌癥類(lèi)型,鑒別出了127個(gè)似乎驅動(dòng)了機體眾多腫瘤發(fā)生與發(fā)展的多次突變基因。這一研究發(fā)現為設計出新的診斷工具及更個(gè)體化的癌癥治療創(chuàng )造了條件。相關(guān)論文發(fā)表在著(zhù)名科學(xué)期刊《自然》(Nature)雜志上。
論文的資深作者是華盛頓大學(xué)基因研究所的丁莉(Li Ding)博士,其早年畢業(yè)于復旦大學(xué),是世界著(zhù)名的基因科學(xué)家。近期湯森?路透(Thomson Reuter)旗下的ScienceWatch網(wǎng)站,通過(guò)分析論文的引用次數,篩選出了2012年度“最熱門(mén)的科學(xué)家“,全球有21位科學(xué)家入選,丁莉博士榜上有名。 新研究表明通常在某些癌癥中發(fā)生突變的一些基因,也存在于看似無(wú)關(guān)的腫瘤中。例如,一種在25%的白血病病例中發(fā)生突變的基因,也被發(fā)現存在于乳腺癌、直腸癌、頭頸部癌、腎癌、肺癌、卵巢癌和子宮癌中。
基于這些研究結果,研究人員設想采用一種測試來(lái)檢測一組癌基因中的錯誤,最終有可能成為大多數癌癥標準診斷檢查的一個(gè)組成部分。這樣的檢測結果有可能會(huì )基于患者獨特的遺傳特征來(lái)指導治療決策。
由于基因組測序的發(fā)展,科學(xué)家們能夠以比數年前更快的速度,更便宜的價(jià)格對癌細胞DNA展開(kāi)分析,因而使得生成一些關(guān)于癌癥的新見(jiàn)解成為可能。盡管早期的基因組研究通常側重于個(gè)別腫瘤類(lèi)型,當前的研究則是率先聚焦多種不同癌癥類(lèi)型的研究之一。
丁莉博士說(shuō):“這僅僅是一個(gè)開(kāi)始。許多的腫瘤科醫生和科學(xué)家們都想知道,是否有可能能夠提出一個(gè)導致所有人類(lèi)癌癥的癌基因完整清單。我認為我們正越來(lái)越接近它。”
新研究分析了來(lái)自3,281個(gè)腫瘤的基因——這些腫瘤匯集了乳腺癌、子宮癌、頭頸部癌、結直腸癌、膀胱癌、腎癌、卵巢癌、肺癌、腦癌和血癌。除發(fā)現了不同癌癥中基因之間的一些共同聯(lián)系,研究人員還鑒別出了一些特定癌癥類(lèi)型獨有的突變。
檢測跨越許多不同癌癥類(lèi)型的大量腫瘤,為研究人員提供了必要的統計效力來(lái)鑒別顯著(zhù)突變基因。這些頻繁發(fā)生于某些癌癥,而在另一些癌癥中很少存在的遺傳錯誤,被認為對于癌癥生長(cháng)極其重要。
盡管腫瘤中突變基因的平均數量隨癌癥類(lèi)型各異,大多數的腫瘤都只有2-6個(gè)驅動(dòng)癌癥的基因突變。研究人員說(shuō),這或許就是為何癌癥如此常見(jiàn)的一個(gè)原因。“盡管體內的細胞多年來(lái)不斷地累積新突變,將一個(gè)健康細胞轉變?yōu)榘┘毎麆t只需要重要驅動(dòng)基因的少數幾個(gè)突變,”丁莉說(shuō)。
包括共同第一作者、華盛頓大學(xué)的Cyriac Kandoth博士和Michael McLellan,以及合作者、布朗大學(xué)的Benjamin Raphael博士在內的科學(xué)家們,鑒別出了對于生存具有重要影響的基因。
TP53,一種眾所周知的癌相關(guān)基因,其在不同的癌癥類(lèi)型中最為常見(jiàn)。它被發(fā)現存在于42%的樣本,尤其是在腎癌、頭頸部癌和急性髓細胞性白血病中,與不良預后相關(guān)。
另一個(gè)基因BAP1也與不良預后有關(guān),特別是在腎癌和子宮癌患者中。
而乳腺癌基因BRCA2突變則與卵巢癌生存率增高相關(guān),IDH1錯誤與一種尤其具侵襲性的腦瘤——成膠質(zhì)細胞瘤及其他的癌癥類(lèi)型預后改善相關(guān)。
華盛頓大學(xué)基因組研究所目前正在開(kāi)展一項尋找其他癌基因的研究。制定出一張更全面的癌基因列表有可能為改善癌癥診斷,指導治療決策提供支持。
“由于我們現在知道,例如在白血病中突變的基因也可以在乳腺癌中發(fā)生改變,肺癌中的遺傳錯誤也可以出現在結直腸癌中,我們認為開(kāi)發(fā)出一種納入所有的癌基因的診斷測試將是完美的。這將能夠為我們提供更為完整的腫瘤發(fā)生事件圖像,并且可以利用這些信息來(lái)制定治療決策,”丁莉說(shuō)。
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