德國慕尼黑工業(yè)的研究人員利用一項新技術(shù)鑒別出了基因測序難以辨認的癌癥病因,揭示出了大量從前未知的胰腺癌基因。其有望推動(dòng)對于這一目前仍知之甚少的疾病的研究。相關(guān)論文發(fā)表在12月8日的《自然-遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上。
胰腺癌是惡性度高、預后差的一種腫瘤,在過(guò)去的40年里患者的5年生存率一直在5%左右。由于胰腺的位置隱蔽,早期胰腺癌很難被發(fā)現,多數患者確診時(shí)已是晚期,加之病死率極高,因此被稱(chēng)為“癌中之王”.
這一技術(shù)是通過(guò)將稱(chēng)作為piggyBac轉座子的DNA片段導入到小鼠基因組中來(lái)起作用的。轉座子能夠在基因組中四處跳躍,將自身重新插入隨機位點(diǎn),在每個(gè)小鼠細胞中生成不同的突變,這觸發(fā)了癌癥形成。通過(guò)在腫瘤中追蹤這一轉座子的指紋,研究人員發(fā)現了受累的致癌基因。這是研究人員首次操控PiggyBac工具在小鼠的個(gè)別組織中誘導癌癥,現在這一方法可用于研究所有的癌癥類(lèi)型。
盡管基因組測序可以高精確度鑒別所有類(lèi)別的遺傳變異,卻難以解讀其中的一些改變。例如,在癌癥中有數百或數千個(gè)基因被發(fā)現在轉錄或表觀(guān)遺傳水平上出現了異常調控,這意味著(zhù)它們并沒(méi)有發(fā)生突變而是被開(kāi)啟或關(guān)閉。在這樣大量的基因中精確找到少數的致癌事件非常的困難。由于轉座子可以直接跳躍到相關(guān)基因中,PiggyBac篩查可以讓這種大海撈針的搜索變得更容易。并且,這一工具還可監測小鼠體內的腫瘤形成,因此研究人員還能夠看到癌性突變的影響,以及它們推動(dòng)疾病進(jìn)展的機制。
慕尼黑工業(yè)大學(xué)和德國癌癥研究中心的Roland Rad教授說(shuō):“近期在癌癥基因組測序中取得的一些進(jìn)展提供了有關(guān)癌癥潛在遺傳事件的一些非凡見(jiàn)解。盡管如此,我們仍遠未充分認識驅動(dòng)癌癥形成的分子過(guò)程的復雜性。在小鼠中進(jìn)行無(wú)偏倚的全基因組篩查使得我們能夠從不同的角度來(lái)查看癌癥,解答采用其他方法無(wú)法解決的一些生物學(xué)問(wèn)題。”
這項研究鑒別出了許多從前未知的、與胰腺癌相關(guān)的基因,包括Foxp1,在所研究的49個(gè)小鼠腫瘤中轉座子以非常高的頻率擊中了它。在誘導Foxp1的地方,腫瘤從胰腺擴散到了其他的器官,表明這一基因驅動(dòng)了癌癥進(jìn)展。當研究人員檢測人類(lèi)樣本時(shí)這一研究發(fā)現得到了證實(shí),他們發(fā)現在已發(fā)生轉移的癌癥中有高水平的**P1基因產(chǎn)物。
在許多小鼠中,轉座子插入到了基因組的非編碼區域。這些插入準確地定位了與一些致癌基因調控相關(guān)的增強子區域。此外,與人類(lèi)相似,小鼠形成了各種亞型的胰腺癌,它們不僅顯示差異性的鏡下特點(diǎn),也表現不同的臨床行為。這項研究發(fā)現了負責觸動(dòng)這些癌癥亞型形成的一些分子過(guò)程。
研究人員現正更密切地檢測這項研究發(fā)現的一些胰腺癌基因,希望能夠找到針對這一疾病的有效藥物。到2030年胰腺癌將成為第二位的癌癥死亡原因。一些實(shí)驗室也已開(kāi)始利用這一技術(shù)調查其他組織的癌癥。
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