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諾獎得主揭示基因突變與疾病的聯(lián)系

2012-11-15 13:16 閱讀:1850 來(lái)源:生物通 作者:網(wǎng)* 責任編輯:網(wǎng)絡(luò )
[導讀] 研究人員對100,000名加州人的遺傳學(xué)數據和醫療信息進(jìn)行了研究,揭示了遺傳學(xué)突變、端粒與疾病之間的緊密聯(lián)系,端粒是染色體末端保護性的DNA序列。

    目前美國最大規模的biobank在本周美國人類(lèi)遺傳學(xué)學(xué)會(huì )ASHG的年會(huì )上發(fā)布了他們的初步成果。研究人員對100,000名加州人的遺傳學(xué)數據和醫療信息進(jìn)行了研究,揭示了遺傳學(xué)突變、端粒與疾病之間的緊密聯(lián)系,端粒是染色體末端保護性的DNA序列。大型保健機構Kaiser Permanente(KP)是該biobank的建立者,他們稱(chēng)這些成果還只是個(gè)開(kāi)端。

    這一項目旨在收集大量人群的醫療信息和DNA數據,以便分析疾病、生活方式、遺傳學(xué)特征與基因之間的關(guān)聯(lián)。與此類(lèi)似的還有,冰島著(zhù)名生物公司deCODE genetics十多年前率先建立的biobank,現擁有140,000冰島人的數據。而目前全球最大的Biobank在英國,目前已登記500,000人,不過(guò)還未進(jìn)行DNA檢測。

    在NIH耗資兩千五百萬(wàn)美元為期兩年的資助下,KP與加州大學(xué)合作在公司醫療系統中對100,000加州人的基因組進(jìn)行了篩查。研究人員還檢測了參與者的端粒長(cháng)度,端粒隨著(zhù)細胞的每一次分裂逐漸縮短,達到一定程度就會(huì )使細胞進(jìn)入衰老階段。上述參與者平均年齡63歲,其中81%是白種人其他還包括亞洲人、拉丁美洲人和非洲裔美國人,這些參與者都填寫(xiě)了健康調查表。研究人員將這些參與者的遺傳信息與其病例中的臨床數據結合起來(lái),證實(shí)SNP遺傳學(xué)標志和膽固醇水平與心臟病風(fēng)險關(guān)系密切。

    研究揭示了可能影響膽固醇水平的新SNP,研究人員還指出,與此前的SNP研究相比該研究中已知膽固醇相關(guān)SNP與疾病的關(guān)系更緊密。這是該biobank規模大臨床信息質(zhì)量高所帶來(lái)的優(yōu)勢,其他小規模且分散的研究無(wú)法與之媲美。

    2009年因端粒研究榮獲諾貝爾生理學(xué)/醫學(xué)獎的伊麗莎白·布萊克本(Elizabeth Blackburn)為KP的這項研究提供了端粒檢測。研究團隊證實(shí)老年人、抽煙者和酗酒者的端粒更短,但并未發(fā)現之前有些研究報道的其他關(guān)聯(lián)。例如他們并未發(fā)現常運動(dòng)的人端粒會(huì )更長(cháng),研究也未顯示端粒短與死亡風(fēng)險有關(guān),而這些都是一些小規模研究得出的結論。短端粒是否會(huì )直接導致死亡,抑或是通過(guò)影響其他因素導致死亡,這一問(wèn)題一直存在爭議,但本研究未能解決這一問(wèn)題。

    KP biobank醫療記錄中的匿名數據(從藥物使用到腦部影像)也對其他研究人員開(kāi)放,他們希望這些數據能夠得到廣泛應用。這些數據將會(huì )發(fā)布在NIH分享SNP數據的數據庫dbGaP中,研究者們也可以申請與KP團隊進(jìn)行合作。至于如何應用這樣大量的數據完全由研究者們自行決定。例如,可以結合空氣污染數據來(lái)分析疾病與污染的關(guān)系。該biobank的規模還在持續擴大,總共有200,000名KP成員捐贈了生物樣本,并且已有430,000人表示愿意參與這一項目。

    Johns Hopkins大學(xué)的人類(lèi)遺傳學(xué)家Aravinda Chakravarti正在考慮與KP合作,不過(guò)他也表示了自己的擔憂(yōu),在A(yíng)SHG會(huì )議上許多人都在關(guān)注用測序等方法揭示疾病基因。他說(shuō),“我們這一領(lǐng)域的問(wèn)題在于,總在不停的列出疾病相關(guān)基因的清單”,他更傾向于研究這些基因的功能及其發(fā)病機理。


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