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    最近，新加坡A*STAR基因組研究所（GIS）的科學(xué)家開(kāi)發(fā)出一種新技術(shù)，簡(jiǎn)化了準確識別致病DNA突變的任務(wù)，為新藥開(kāi)發(fā)和新的疾病診斷法奠定了基礎。
 

    設計新的藥物治療糖尿病、類(lèi)風(fēng)濕性關(guān)節炎這樣的疾病，通常是非常困難的，因為我們不知道藥物應該靶定體內哪些分子。如果我們能夠找出導致特定疾病的基因突變，我們就可以將這些突變與特定蛋白質(zhì)聯(lián)系起來(lái)，然后設計藥物來(lái)阻斷或激活這些蛋白。我們還可以測量以這種方式確定的蛋白質(zhì)的活性，更準確地診斷疾病，這是精密醫學(xué)的一個(gè)主要目標。延伸閱讀：DNA轉錄和致病擴增之間的聯(lián)系。

    GIS綜合基因組學(xué)副主任Shyam Prabhakar帶博士領(lǐng)的一個(gè)科學(xué)家團隊，開(kāi)發(fā)了一種新的遺傳分析技術(shù)，稱(chēng)為Genotype-independent Signal Correlation and Imbalance （G-SCI）試驗，可檢測基因組中特定的化學(xué)變化，并將它們連接到附近的基因突變。然后他們發(fā)現，與這些化學(xué)變化相關(guān)的基因突變也可能導致疾病。G-SCI測試在一項包含57個(gè)人的研究中得到了驗證，相關(guān)研究結果發(fā)表在最近的《自然方法》（Nature Methods）。

    當在這項研究中與化學(xué)分析方法結合使用時(shí)，在識別有害基因突變方面，G-SCI試驗比現有的方法敏感10倍。該研究的共同第一作者、GIS的Ricardo del Rosario說(shuō)：“G-SCI測試是變革的——不是檢測500個(gè)人的基因表達相關(guān)性，而是進(jìn)行僅僅50至60的組蛋白乙酰化分析。這減少了每項研究需要的受試者數量，并使得我們能夠深入調查疾病。”

    本研究另外共同第一作者、GIS 的Jeremie Poschmann博士，強調新方法的另一個(gè)好處：“我們不是使用基因組測序，而是利用來(lái)自于我們方法檢測DNA突變的組蛋白乙酰化測序數據。這為我們節省了大量的時(shí)間、精力和資源。”

    加州大學(xué)圣地亞哥分校（UCSD）細胞與分子醫學(xué)系、Ludwig癌癥研究所的任兵教授評價(jià)說(shuō)：“這是一項令人興奮的研究，為基因調控的遺傳分析設立了一種新的基準。該方法大大提高了我們理解人類(lèi)基因組的能力，并將有利于疾病遺傳基礎的研究。”

    科學(xué)家們驗證了新測試的有效性，并能夠識別與某些遺傳疾病的聯(lián)系。Prabhakar博士說(shuō)：“我們發(fā)現，擾動(dòng)基因組化學(xué)狀態(tài)的突變，與引起自身免疫性疾病的突變之間有著(zhù)強烈關(guān)聯(lián)。這時(shí)我們知道，我們用G-SCI測試方法命中了靶心。”

    斯坦福大學(xué)的Jonathan Pritchard 教授評論說(shuō)：“這項工作，為將遺傳變異與染色質(zhì)功能變異相關(guān)聯(lián)，提供了重要的新工具，并提供了令人信服的證據表明，這類(lèi)遺傳變異在人類(lèi)疾病中起著(zhù)核心作用。”

    GIS執行董事Huck-Hui Ng 教授表示：“我很高興，這一新方法具有卓越的精度用于鑒定致病突變。G-SCI方法創(chuàng )新性地利用遺傳信息，來(lái)選擇人類(lèi)基因組區域用于疾病關(guān)聯(lián)分析。隨著(zhù)我們看到越來(lái)越大和越來(lái)越復雜的數據集，業(yè)界將面臨即將到來(lái)的大數據分析挑戰。該方法擴展了新加坡基因組研究所的計算分析能力。”