據美國物理學(xué)家組織網(wǎng)1月4日報道,美國南加利福尼亞大學(xué)多恩希夫文理學(xué)院的科學(xué)家,開(kāi)發(fā)出一種繪制DNA(脫氧核糖核酸)之間接觸位點(diǎn)的新方法,并利用計算機模型繪制出一個(gè)細胞中的完整DNA鏈——基因組的精確三維圖像。相關(guān)論文預先發(fā)表在《自然·生物技術(shù)》網(wǎng)站上。
細胞內的基因組就像一碗細絲面,不同的細胞就像不同的碗,其中的面條雖然整體上排列不同,但都有著(zhù)某些共同特征。DNA鏈非常細小卻長(cháng)度驚人,假如細胞核像一個(gè)足球那么大,其內部DNA解開(kāi)的話(huà)會(huì )長(cháng)達30多英里。它們在細胞核內部卷曲纏繞,自身之間形成了數十億的接觸點(diǎn)。
研究人員用了一種新技術(shù),標繪出了DNA之間的每一個(gè)接觸位點(diǎn)。由于DNA的卷曲方式不盡相同,他們還考慮了每個(gè)細胞的細微差別,對許多基因組進(jìn)行統計分析,確定了DNA鏈的“優(yōu)先位置”,也就是DNA最可能出現的位置,最終通過(guò)精密復雜的計算機算法模擬出了最終的三維圖像。
“生物研究中的每件事物都是三維的,因此必須從三維的角度才能全面理解它們。” 文理學(xué)院分子生物學(xué)教授陳林(音譯)說(shuō),“DNA三維圖像以全新的視角向人們展示了基因組,通過(guò)分析不同細胞之間基因組的差異和相似之處,人們能從中找出某些三維組織結構的基本規則。而且,三維結構能顯示出每個(gè)基因相對于其他基因的位置,以及這種排列對細胞功能的重要性。”
基因組結構上的瑕疵會(huì )導致癌癥等各種疾病,理解基因組的結構對理解其整體功能至關(guān)重要。
陳林指出,該研究有助于人們理解正常細胞和疾病細胞中的基因組,根據細胞中基因組的結構缺陷發(fā)現潛在癌細胞。“這些研究在未來(lái)很有前景,能幫助科學(xué)家更好地理解基因組和疾病之間的關(guān)系,以及如何在相應的環(huán)境中調控其功能。”
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